En el marco de la misión de la UAM, formar Ingenieros de Sistemas con actitud investigativa, de auto-aprendizaje, de trabajo interdisciplinario con capacidad de analizar y modelar procesos organizacionales y de información y de desarrollar soluciones computacionales desde una visión sistémica fundamentada en los conocimientos científicos y tecnológicos propios de la disciplina.

El Ingeniero de Sistemas de la Universidad Autónoma de Manizales es un profesional autónomo con capacidad de autoaprendizaje y vocación de trabajo interdisciplinario; capaz de formalizar los procesos y la estructura de información de una organización, con iniciativa empresarial y una sólida fundamentación científica.

Las posibilidades de desempeño se orientan a los siguientes campos:

• Líder (Director y organizador) de proyectos de tecnología de información.
• Analista, diseñador, programador y administrador de sistemas de información
• Empresario de organizaciones de índole tecnológica en TIC y en desarrollo de software
• Diseñador e implementador de Bases de Datos y Redes de computadores
• Diseñador e implementador de Sistemas Computacionales
• Consultor/asesor técnico en Sistemas Informáticos, Ingeniería del Software y Bases de Datos.

El plan de estudios contempla asignaturas de diferentes campos de conocimiento, relacionadas con la Ingeniería de Sistemas, organizadas en áreas de formación así:

Área de Formación Básica: Está orientada a la comprensión de la teoría y métodos disciplinares. Comprende asignaturas relacionadas con la formación básica en Matemáticas, Física y Computación.
Área de Formación Profesional: Profundiza en los aspectos disciplinares propios de la profesión. Comprende diferentes asignaturas de carácter teórico práctico y el desarrollo de talleres y proyectos. Incluye diferentes asignaturas de Programación, Informática Teórica, Redes y Comunicaciones, Administración de Información, Ingeniería de Software y Gestión de proyectos tecnológicos. También contempla una Práctica Empresarial en el área.
Formación Sociohumanística: Permite comprender la relación hombre, sociedad y conocimiento, como base del proceso de formación, proyectándolos como personas y como expertos en el área de Ingeniería de Sistemas. Son asignaturas de esta área: Cultura Política, Filosofía de la Ciencia, Ética, Desarrollo Sostenible, Espíritu Empresarial, Administración, Deporte o Arte y Paz y Competitividad.
Área de Formación Complementaria: Propicia la integración de conocimientos de otras disciplinas de acuerdo con el interés del estudiante, a través de quince créditos académicos de libre configuración. Estos créditos se pueden tomar en cualquiera de los otros programas académicos que ofrece la universidad o en otros programas acreditados del país. La institución también ofrece la formación en Inglés mediante seis niveles.
Proceso de Investigación: Los estudiantes tienen la oportunidad de desarrollar habilidades investigativas, mediante su participación en labores académicas y proyectos de los grupos de investigación institucionales.