Es un grupo interdisciplinar que investiga en el diseño, implementación y aplicación de nuevas tendencias tecnológicas con base en disciplinas como biomédica, electrónica, mecatrónica y computación. 

Nuestras principales fortalezas radican en el diseño electrónico y el análisis de datos, señales, imágenes o videos, liderando proyectos enfocados en el internet de las cosas e inteligencia artificial para la inserción de nuevas tecnologías en el sector industrial (industria 4.0), y sistemas de diagnóstico asistido por computador para la detección de enfermedades neurodegenerativas, cardíacas, carcinógenas, entre otras.

A
Escalafón
Investigadores
Julian Camilo
Julian Camilo  Caicedo Acosta

Cargo:   Docente

Correo electrónico:   julianc.caicedoa@autonoma.edu.co
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Vanessa
Vanessa  Martínez Diaz

Cargo:  

Correo electrónico:   vmartinez@autonoma.edu.co
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Oscar
Oscar  Cardona Morales

Cargo:   Docente

Correo electrónico:   oscar.cardonam@autonoma.edu.co
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Reinel
Reinel  Tabares Soto

Cargo:   Docente

Correo electrónico:   rtabares@autonoma.edu.co
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Rubén Darío
Rubén Darío  Flórez Hurtado

Cargo:   Coordinador

Correo electrónico:   rubenfh@autonoma.edu.co
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mateo-hurtado-hernandez
Mateo  Hurtado Hernández

Cargo:   Docente

Correo electrónico:   mateo.hurtadoh@autonoma.edu.co
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  • Bioingeniería: Se enfoca en el desarrollo y aplicación de múltiples tecnologías en el campo de la ingeniería biomédica, abarcando desde la interdisciplinariedad temáticas como biomecánica, ingeniería clínica, realidad virtual y procesamiento de señales aplicado a la ingeniería de rehabilitación y discapacidad, telemedicina y teleasistencia.

 

  • Instrumentación y Control: Se enfoca en el diseño, implementación y validación de dispositivos electrónicos que contribuyan al desarrollo tecnológico de los sectores industrial, residencial y de servicios. Incluye temáticas como automatización y control, internet de las cosas, sensórica, electrónica de potencia, conversión de energía, y comunicaciones electrónicas.

 

  • Mecatrónica: Se enfoca en el análisis, diseño e implementación de sistemas que combinan conocimientos de áreas como la mecánica, la electrónica, la computación y el diseño industrial. Atiende a soluciones basadas en el análisis de movimiento, la biomecánica y la robótica.

 

  • Procesamiento de Señales: Se enfoca en el análisis, diseño, implementación y validación de modelos computacionales aplicados a los sectores de salud, energía, industria y de servicios basados en técnicas de procesamiento de señales y de imágenes, aprendizaje automático, aprendizaje profundo e inteligencia artificial.
  • Durango-Idárraga, S., Delgado-Martínez, M. C., Álvarez-Vargas, C. A., Flórez-Hurtado, R. D., & Flórez-Ruiz, M. A. (2020). Kinematic Design of a 2-PRR Parallel Robot. Scientia et Technica, Vol. 25, Nº. 3, págs. 372-379 https://dialnet.unirioja.es/descarga/articulo/7581816.pdf
  • Padilla-Buritica, J. I., Ferrandez-Vicente, J. M., Castaño, G. A., & Acosta-Medina, C. D. (2020). Non-stationary group-level connectivity analysis for enhanced interpretability of oddball tasks. Frontiers in Neuroscience, Vol. 14:446, doi: 10.3389/fnins.2020.00446
  • Orozco-Arias S, Jaimes PA, Candamil MS, Jiménez-Varón CF, Tabares-Soto R, Isaza G, Guyot R. InpactorDB: A Classified Lineage-Level Plant LTR Retrotransposon Reference Library for Free-Alignment Methods Based on Machine Learning. Genes (Basel). 2021 Jan 28;12(2):190. doi: 10.3390/genes12020190.
  • Guyot R, Hamon P, Couturon E, Raharimalala N, Rakotomalala JJ, Lakkanna S, Sabatier S, Affouard A, Bonnet P. WCSdb: a database of wild Coffea species. Database (Oxford). 2020 Nov 20;2020:baaa069. doi: 10.1093/database/baaa069.
  • Orozco-Arias S, Tobon-Orozco N, Piña JS, Jiménez-Varón CF, Tabares-Soto R, Guyot R. TIP_finder: An HPC Software to Detect Transposable Element Insertion Polymorphisms in Large Genomic Datasets. Biology (Basel). 2020 Sep 9;9(9):281. doi: 10.3390/biology9090281.
  • Konan JA, Guyot R, Koffi KK, Vroh-Bi I, Zoro AIB. Molecular confirmation of varietal status in bottle gourd (Lagenaria siceraria) using genotyping-by-sequencing. Genome. 2020 Nov;63(11):535-545. doi: 10.1139/gen-2020-0050.
  • Charr JC, Garavito A, Guyeux C, Crouzillat D, Descombes P, Fournier C, Ly SN, Raharimalala EN, Rakotomalala JJ, Stoffelen P, Janssens S, Hamon P, Guyot R. Complex evolutionary history of coffees revealed by full plastid genomes and 28,800 nuclear SNP analyses, with particular emphasis on Coffea canephora (Robusta coffee). Mol Phylogenet Evol. 2020 Oct;151:106906. doi: 10.1016/j.ympev.2020.106906.
  • Wu S, Guyot R, Bocs S, Droc G, Oktavia F, Hu S, Tang C, Montoro P, Leclercq J. Structural and Functional Annotation of Transposable Elements Revealed a Potential Regulation of Genes Involved in Rubber Biosynthesis by TE-Derived siRNA Interference in <i>Hevea brasiliensis</i>. Int J Mol Sci. 2020 Jun 13;21(12):4220. doi: 10.3390/ijms21124220.
  • Ly SN, Garavito A, De Block P, Asselman P, Guyeux C, Charr JC, Janssens S, Mouly A, Hamon P, Guyot R. Chloroplast genomes of Rubiaceae: Comparative genomics and molecular phylogeny in subfamily Ixoroideae. PLoS One. 2020 Apr 30;15(4):e0232295. doi: 10.1371/journal.pone.0232295.
  • Hufnagel B, Marques A, Soriano A, Marquès L, Divol F, Doumas P, Sallet E, Mancinotti D, Carrere S, Marande W, Arribat S, Keller J, Huneau C, Blein T, Aimé D, Laguerre M, Taylor J, Schubert V, Nelson M, Geu-Flores F, Crespi M, Gallardo K, Delaux PM, Salse J, Bergès H, Guyot R, Gouzy J, Péret B. High-quality genome sequence of white lupin provides insight into soil exploration and seed quality. Nat Commun. 2020 Jan 24;11(1):492. doi: 10.1038/s41467-019-14197-9.
  • Orozco-Arias S, Isaza G, Guyot R, Tabares-Soto R. A systematic review of the application of machine learning in the detection and classification of transposable elements. PeerJ. 2019 Dec 18;7:e8311. doi: 10.7717/peerj.8311.
  • Orozco-Arias S, Isaza G, Guyot R. Retrotransposons in Plant Genomes: Structure, Identification, and Classification through Bioinformatics and Machine Learning. Int J Mol Sci. 2019 Aug 6;20(15):3837. doi: 10.3390/ijms20153837.
  • Guyeux C, Charr JC, Tran HTM, Furtado A, Henry RJ, Crouzillat D, Guyot R, Hamon P. Evaluation of chloroplast genome annotation tools and application to analysis of the evolution of coffee species. PLoS One. 2019 Jun 12;14(6):e0216347. doi: 10.1371/journal.pone.0216347.
  • Orozco-Arias S, Liu J, Tabares-Soto R, Ceballos D, Silva Domingues D, Garavito A, Ming R, Guyot R. Inpactor, Integrated and Parallel Analyzer and Classifier of LTR Retrotransposons and Its Application for Pineapple LTR Retrotransposons Diversity and Dynamics. Biology (Basel). 2018 May 25;7(2):32. doi: 10.3390/biology7020032.
  • de Castro Nunes R, Orozco-Arias S, Crouzillat D, Mueller LA, Strickler SR, Descombes P, Fournier C, Moine D, de Kochko A, Yuyama PM, Vanzela ALL, Guyot R. Structure and Distribution of Centromeric Retrotransposons at Diploid and Allotetraploid Coffea Centromeric and Pericentromeric Regions. Front Plant Sci. 2018 Feb 15;9:175. doi: 10.3389/fpls.2018.00175. PMID: 29497436;
  • Jiménez-Varón, C.F., Tabares-Soto, R.(2015). Design of a production plant of LDPE in Colombia. Revista Vector, 10(2015), 59. 
  • Tamayo, M., Tabares, R., Montes, N., Gustavo, O. (2015). Three-dimensional indexing in GPU for numerical approximation of solutions of the Laplace equation. Revista Antioqueña de las Ciencias Computacionales y la Ingenieria de Software, 5(2),37. 
  • Jiménez-Varón, C.F., Tabares-Soto, R.(2018). Dinámica no lineal del mercado del café en Colombia. Revista Mutis, 8(2), 73. 
  • Ceballos, D., López-Álvarez, D.,Isaza, G., Tabares-Soto, R., Orozco-Arias, S., & Ferrin, C.D.(2019). A Machine Learning-based Pipeline for the Classification of CTX-M in Metagenomics Samples. Processes, 7(4), 235. 
  • Orozco-Arias, S., Núñez-Rincón, A.M., Tabares-Soto, R., & López-Álvarez, D. (2019). Worldwide co-occurrence analysis of 17 species of the genus Brachypodium using data mining. PeerJ, 6, 6193.
  • Tabares-soto, R., Ramos-Pollán, R., & Isaza, G. (2019). Deep Learning Applied to Steganalysis of Digital Images: A Systematic Review, IEEE Access, vol. 7, pp. 68970-68990.
  • Tabares-Soto, R., Orozco-Arias, S., Romero-Cano, V., Segovia Bucheli, V., Rodríguez-Sotelo, J.L., & Jiménez-Varón, C.F. (2020). A comparative study of machine learning and deep learning algorithms to classify cancer types based on microarray gene expression data. PeerJ Computer Science, 6, 270. 
  • Piña Duran, J.S., Orozco Arias, S., Guyot, R., Tabares Soto, R., Tobón Orozco, N., Candamil Cortés, M.S. (2019). Alineamiento gráfico de secuencias a través de programación paralela: un enfoque desde la era postgenómica. Revista Ingeniería Biomédica,13,26. 
  • Tobón Orozco, N., Candamil Cortés, M.S., Piña Duran, J.S., Orozco Arias, S., Guyot, R., Tabares Soto, R, Pérez Agudelo, J.M. (2019). Polimorfismos de inserción de elementos transponibles ligados a cancer de mama: una prueba de concepto,13,26. 
  • Bravo Ortíz, M.A., Arteaga Arteaga, H.B., Tabares Soto, R., Padilla Buriticá, J.I., & Orozco-Arias, S.(2021). Clasificación de cáncer cervical usando redes neuronales convolucionales, transferencia de aprendizaje y aumento de datos. EIA, 18, 35. 
  • Tabares-Soto, R., Arteaga-Arteaga, H.B., Bravo-Ortiz, M.A., Mora-Rubio, A., Arias-Garzón, D., Alzate-Grisales, J.A., Burbano-Jacome, A.B., Orozco-Arias, S., Isaza, G., Ramos-Pollán, R.(2021). GBRAS-Net: A Convolutional Neural Network Architecture for Spatial Image Steganalysis. IEEE Access, 9, 14340-14350.
  • Orozco-Arias, S., Jaimes, P. A., Candamil, M. S., Jiménez-Varón, C. F., Tabares-Soto, R., Isaza, G., & Guyot, R. (2021). InpactorDB: A Classified Lineage-Level Plant LTR Retrotransposon Reference Library for Free-Alignment Methods Based on Machine Learning. Genes, 12(2), 190.
  • Lorente-Leyva, L. L., Herrera-Granda, I. D., Rosero-Montalvo, P. D., Ponce-Guevara, K. L., Castro-Ospina, A. E., Becerra, M. A., ... & Rodríguez-Sotelo, J. L. (2018, June). Lecture Notes in Computer Science ISSN: 0302-9743, 2018 vol:10878 fasc: págs: 318 - 328, DOI:10.1007/978-3-319-92537-0_37
  • Montoya, S., López, D. M., & Segura, B. (2018). Influencia de la luz azul sobre la productividad del cultivo sólido de Ganoderma lucidum. Revista Colombiana de Biotecnología, 20(1), 51-58.
  • García, F. N. J., Giraldo, B. S., Torres, L. R. G., Ospina, J. A. C., Londoño, O. M., & Sossa, P. A. F. (2018). Obtención y caracterización de recubrimientos de Brushita, Dióxido de Titanio (TiO2) y sus bicapas sobre acero 316L. Entre Ciencia e Ingeniería, 12(23), 131-139.
  • Sotelo, J. L. R., Londoño, A. L., Botero, C. A. V., & Hurtado, R. D. F. (2017). Sistema de monitoreo y control remoto usando IOT para un regulador de presión. Scientia et technica, 22(4), 391-397.
  • Serna, D. R. V., Rodríguez, D. M. F., Andrade, E. G., Sánchez, D. D. B., & Polanco, H. V. (2017). La disrupción digital (I): modelos de negocio, innovación, conocimiento y tecnología. Revista Vector, 12, 22-31.
  • Rendón, S. M., Giraldo, B. S., & de Mejía, F. R. (2017, June). Design of an Intelligent Computational System for the Cognitive Training of People with Verbal Fluency Problems Associated to the Mild Cognitive Impairment. Advances in Intelligent Systems and Computing. vol:619 fasc: págs: 315 - 319, DOI:10.1007/978-3-319-61578-3_48
  • Rodríguez-Sotelo, J. L., Peluffo-Ordóñez, D. H., López-Londoño, D., & Castro-Ospina, A. (2017, June). Segment clustering for holter recordings analysis. Lecture Notes In Computer Science. vol:10337 fasc: N/A págs: 456 - 463, DOI:10.1007/978-3-319-59740-9_45
  • Rodríguez-Sotelo, J. L., Osorio-Forero, A., Jiménez-Rodríguez, A., Restrepo-de-Mejía, F., Peluffo-Ordóñez, D. H., & Serrano, J. (2017, June). Sleep Stages Clustering Using Time and Spectral Features of EEG Signals. Lecture Notes In Computer Science. vol:10337 fasc: N/A págs: 444 - 455, DOI:10.1007/978-3-319-59740-9_44
  • Ángel-López, J. P., & de la Peña, N. A. (2017). Voice Controlled Prosthetic Hand with Predefined Grasps and Movements. Ifmbe Proceedings. vol:60 fasc: págs: 520 - 523, DOI:10.1007/978-981-10-4086-3_131.
  • Ángel-López, J. P., Segura-Giraldo, B., Rodríguez-Sotelo, L. D., & García-Solano, K. B. (2017). Kinematic Soccer Kick Analysis Using a Motion Capture System. Ifmbe Proceedings. vol:60 fasc: págs: 682 - 685, DOI:10.1007/978-981-10-4086-3_171
  • Ángel-López, J. P., & Murillo-Rendón, S. (2017, June). Environment Mapping with Mobile Robot Guided by a Markers Vision System. Advances in Intelligent Systems and Computing. vol:615 fasc: págs: 149 - 158, DOI:10.1007/978-3-319-61118-1.
  • Gil, L. J., Castillo, L. F., & Flórez, R. D. (2016) Reconocimiento de comandos de voz en español orientado al control de una silla de ruedas. Uis Ingenierías. vol:15 fasc: 2 págs: 35 – 48
  • Segura, B., Jiménez, F. N., & Giraldo, L. R. (2016). Prototipo de potenciostato con aplicaciones en procesos electroquímicos. Entre ciencia e ingeniería, 10(19), 61-69.
  • Caicedo-Eraso, J. C., Arango, F. O. D., & Varón-Serna, D. R. (2016). Espectroscopia de impedancia eléctrica aplicada durante la fermentación húmeda del café. Vitae, 23, 195.
  • Sanchez-Ocampo, M., Segura-Giraldo, B., Florez-Hurtado, R., & Cortés-Aguirre, C. (2016, April). Design of a prototype device for remote patient care with mild cognitive impairment. In Journal of Physics: Conference Series (Vol. 705, No. 1, p. 012045). IOP Publishing.
  • Sanchez-Ocampo, M., Segura-Giraldo, B., Florez-Hurtado, R., & Cortés-Aguirre, C. (2016, April). Design of a prototype device for remote patient care with mild cognitive impairment. In Journal of Physics: Conference Series (Vol. 705, No. 1, p. 012045). IOP Publishing.
  • Construcción y validación de un equipo de ventilación mecánica para terapia intensiva basado en mecanismos modulares que garantice el abastecimiento mediante una línea de producción a bajo costo y de alto nivel de confiabilidad para el tratamiento de COVID-19
  • Sistema de ventilación no invasivo de presión positiva CPAP AIRFLIFE. 
  • Desarrollo de un sistema de visión artificial basado en redes neuronales y aprendizaje profundo para uso en procesos productivos y de logística.
  • Hacia el entendimiento de genomas de plantas de interés productivo usando técnicas de bioinformática, HPC e inteligencia artificial.
  • Implementación del Programa para diagnóstico y control de enfermedades crónicas no transmisibles y Cáncer de Cervix y mama, con el apoyo de TIC en el Departamento de Caldas
  • Detección de COVID-19 en imágenes de rayos X usando redes neuronales convolucionales
  • Identificación de marcadores moleculares sanguíneos, genéticos y electroencefalográficos de estrés en víctimas del conflicto armado colombiano.
  • Diagnóstico de la enfermedad de Parkinson mediante PREs, polisomnografía y microbiota intestinal
  •  Aplicación de redes neuronales convolucionales a Estegoanálisis
  • Detección temprana de la enfermedad de Parkinson mediante síntomas no motores
  • EKG 20 bits de resolución y bajo ruido.
  • Sensor y Holter de bioimpedancia.
  •  Electromiógrafo 18 bits de resolución.
  • Modulador microcontrolado para telemetría de datos sísmicos provenientes de geófonos.
  • Captura 3D de Marcha basada en Visión Estéreo
  • Acelerómetro de balance de fuerza
  • Control microcontrolado de ignición electrónica.
  • Programación segura estocástica de la generación en sistemas interconectados.
  • Desarrollo de algoritmos computacionales basados en el procesamiento digital de señales e imágenes para el soporte del diagnóstico médico.

 

Hurtado-Rincón, J. V., Restrepo, F., Padilla, J. I., Torres, H. F., & Castellanos-Dominguez, G. (2018, December). Functional connectivity analysis using the oddball auditory paradigm for attention tasks. In International Conference on Brain Informatics (pp. 99-108). Springer, Cham.

Avendano, L. E., Padilla, J. I., Delgado-Trejos, E., & Cuesta-Frau, D. (2020, September). Detection of ECG Fiducial Points Using Recursive Estimation and Kalman Filtering. In 2020 Computing in Cardiology (pp. 1-4). IEEE.

D. Rivera, V. Ramírez y M. Buitrago (2020).  Sistema inteligente de recolección de residuos. X Encuentro Regional de Semilleros de Investigación – RREDSI –

Cardona. S, Cortes. D, Echeverri. I, Martinez. L,Márquez. C, Murillo. S, Trujillo. S (2020) Plataforma de rehabilitación para miembro superior en personas con hemiparesia. X Encuentro Regional de Semilleros de Investigación – RREDSI -

Orozco Arias, S., Guyot, R., Tabares Soto, R., Ceballos, D. (2017).Parallan: Parallel Analyzer and Classifier of LTR Retrotransposons. Application to study lateral transfer among plant genomes.CCBCOL: Colombian Conference on Bioinformatics and Computational BiologyAt: Cali, Colombia.

Gallo, G., Tabares, R.,& Osorio, G.(2015).Nonlinear analysis of the Lorenz system and buck converter using GPU. IEEE 2nd Colombian Conference on Automatic Control (CCAC), pp. 1-6. 

Tamayo Monsalve, M.A., Montes Castrillon, N.L., Tabares-Soto, R., & Osorio, G. (2015). Indexing GPU acceleration for solutions approximation of the Laplace equation. 2015 10th Computing Colombian Conference (10CCC), pp. 568-574. 

Orozco-Arias, S., Tabares-Soto, R., Ceballos, D., Guyot, R. (2017). Parallel Programming in Biological Sciences, Taking Advantage of Supercomputing in Genomics. Communications in Computer and Information Science, vol 735.

 

Proyecto "Teleasistencia para el tratamiento de oxígeno domiciliario de neonatos"

Chatbot orientado a resolver las dudas más frecuentes que puedan llegar a tener los acudientes de los pacientes neonatos en teleasistencia con oxígeno domiciliario, el Chatbot ofrece distintas categorías en las que se ofrece información sobre cuidados de los neonatos, signos vitales, teleasistencia y otros temas que pueden llegar a ser de interés para los acudientes. El Chatbot está desplegado en WhatsApp la cual es una plataforma de mensajería ampliamente usada, lo cual facilita el uso y acceso para los acudientes.

Autores: Profesores: Carolina Márquez Narváez, Santiago Murillo Rendón, Isabel Cristina Echeverri Ocampo. Jóvenes investigadores: Carlos Alberto Vera Betancourt, Daniel Henao Díaz.

Aplicación:
Aplicación interactiva que permita agrupar las carillas educativas para los acudientes de los neonatos oxígeno requirentes en casa. De igual manera, brindarles a los acudientes una serie de videos en los cuales se explican algunas técnicas que deben de tener en cuenta y dan algunas recomendaciones para el cuidado de neonato oxígeno requirentes.  


Reanimación cardiopulmonar:
Se presentan las técnicas, recomendaciones y paso a paso de la reanimación cardiopulmonar neonatal. Dentro del video se explica de manera detallada y especifica los pasos que deben de seguir los acudientes de los neonatos para realización dicha reanimación. 


Manejo de oxígeno:
Se presentan recomendación y pasos a seguir de los elementos que se entregan para la administración de oxígeno de los neonatos en casa. Se realiza una pequeña descripción de cada uno de los componentes entregados por las EPS, se muestra cómo es el elemento y se explica cómo es el ensamble de cada uno de los elementos para el suministro de oxígeno. De igual manera, se muestran algunas de las recomendaciones que deben de considerar al momento de la instalación de los elementos y el cuidado de estos.  


Teleasistencias para el neonato con oxigenoterapia: 
Se explica mediante un vídeo animado cómo es el funcionamiento del sistema de teleasistencia y que se hace con la información obtenida por cada uno de los sensores a utilizados para el monitoreo de oxígeno de los neonatos. 
Cuidados básicos
Se dan algunas recomendaciones y advertencias que deben de seguir los acudientes del neonato oxígeno requirente en casa.

El video “Manipulación y Uso del Sistema de Telemonitoreo”, pretende familiarizar a los acudientes con los dispositivos que hacen parte de este sistema, su importancia y funcionamiento. En este caso, se puede observar la conexión y el uso del sensor de presión que se usará para el cálculo del oxígeno que se le suministra al bebé y que generará una alarma cuando exista un cambio.

Profesores: Isabel Cristina Echeverri Ocampo, Santiago Murillo Rendón, Carolina Márquez Narváez, 
Jóvenes investigadores: Valentina Durango Gómez

Teleasistencia para el tratamiento de oxígeno domiciliario de neonatos

Profesores: Santiago Murillo Rendón, Carolina Márquez Narváez, Isabel Cristina Echeverri Ocampo
Jóvenes investigadores: Natalia Ramírez Restrepo, Estefanía Rodríguez Ospina 

Videotutorial: Instrucciones de manejo del software CXR Covid Detector

Videotutorial: Instalación del software CXR Covid Detector

Videotutorial: Preparación de las imágenes para entrenamiento de modelos

Mis primeras respiraciones 

Docentes: Santiago Murillo Rendón, Carolina Márquez Narváez, Isabel Cristina Echeverri Ocampo Jóvenes investigadores: Estefanía Rodríguez Ospina Daniel Henao Díaz.

Actividades de apropiación social del conocimiento en tecnología para reentrenamiento de la marcha

Modelos de inteligencia artificial en el software CXR Covid Detector

¿Qué es CXR y Cómo acceder al software?

Manipulación y uso del sistema de telemonitoreo

Profesores: Isabel Cristina Echeverri Ocampo, Santiago Murillo Rendón, Carolina Márquez Narváez, 
Jóvenes investigadores: Valentina Durango Gómez

  • Software computacional para el Diseño Cinemático Asistido por Computador de Robots Paralelos Simétricos 2-PRR (2020)
  • Software Smart Pet Bin (2020)
  • TIP_finder (2020)
  • SIPRES Analyzer (2019)
  • Impactor (2018)
  • ERP Shape (2018)
  • Aplicación mediante Android para control de Robot Móvil terrestre a través de WiFI. (2017)
  • Preview (forma ágil para visualizar amplitudes y latencias en el estudio de los potenciales relacionados a eventos-ERP) (2017)
  • Sistema de Visualización y Análisis de archivos Mocap  C3D® para fútbil mediante MATLAB® (2017)
  • Herramienta de diagnóstico asistido por computador de deterioro cognitivo leve basado en test cognitivos, árboles de decisión y redes artificiales (2017).
  • Prótesis para amputación transtibial elaborada en material compuesto reforzado con fibra de guadua. (2019)
  • Kit para juego de Boccia. (2018)
  •  Caja de Aprendizaje Instrumental Para Experimentos con Animales (2010)
  • Bioingeniería: Se enfoca en el desarrollo y aplicación de múltiples tecnologías en el campo de la ingeniería biomédica, abarcando desde la interdisciplinariedad temáticas como biomecánica, ingeniería clínica, realidad virtual y procesamiento de señales aplicado a la ingeniería de rehabilitación y discapacidad, telemedicina y teleasistencia.

 

  • Instrumentación y Control: Se enfoca en el diseño, implementación y validación de dispositivos electrónicos que contribuyan al desarrollo tecnológico de los sectores industrial, residencial y de servicios. Incluye temáticas como automatización y control, internet de las cosas, sensórica, electrónica de potencia, conversión de energía, y comunicaciones electrónicas.

 

  • Mecatrónica: Se enfoca en el análisis, diseño e implementación de sistemas que combinan conocimientos de áreas como la mecánica, la electrónica, la computación y el diseño industrial. Atiende a soluciones basadas en el análisis de movimiento, la biomecánica y la robótica.

 

  • Procesamiento de Señales: Se enfoca en el análisis, diseño, implementación y validación de modelos computacionales aplicados a los sectores de salud, energía, industria y de servicios basados en técnicas de procesamiento de señales y de imágenes, aprendizaje automático, aprendizaje profundo e inteligencia artificial.
  • Durango-Idárraga, S., Delgado-Martínez, M. C., Álvarez-Vargas, C. A., Flórez-Hurtado, R. D., & Flórez-Ruiz, M. A. (2020). Kinematic Design of a 2-PRR Parallel Robot. Scientia et Technica, Vol. 25, Nº. 3, págs. 372-379 https://dialnet.unirioja.es/descarga/articulo/7581816.pdf
  • Padilla-Buritica, J. I., Ferrandez-Vicente, J. M., Castaño, G. A., & Acosta-Medina, C. D. (2020). Non-stationary group-level connectivity analysis for enhanced interpretability of oddball tasks. Frontiers in Neuroscience, Vol. 14:446, doi: 10.3389/fnins.2020.00446
  • Orozco-Arias S, Jaimes PA, Candamil MS, Jiménez-Varón CF, Tabares-Soto R, Isaza G, Guyot R. InpactorDB: A Classified Lineage-Level Plant LTR Retrotransposon Reference Library for Free-Alignment Methods Based on Machine Learning. Genes (Basel). 2021 Jan 28;12(2):190. doi: 10.3390/genes12020190.
  • Guyot R, Hamon P, Couturon E, Raharimalala N, Rakotomalala JJ, Lakkanna S, Sabatier S, Affouard A, Bonnet P. WCSdb: a database of wild Coffea species. Database (Oxford). 2020 Nov 20;2020:baaa069. doi: 10.1093/database/baaa069.
  • Orozco-Arias S, Tobon-Orozco N, Piña JS, Jiménez-Varón CF, Tabares-Soto R, Guyot R. TIP_finder: An HPC Software to Detect Transposable Element Insertion Polymorphisms in Large Genomic Datasets. Biology (Basel). 2020 Sep 9;9(9):281. doi: 10.3390/biology9090281.
  • Konan JA, Guyot R, Koffi KK, Vroh-Bi I, Zoro AIB. Molecular confirmation of varietal status in bottle gourd (Lagenaria siceraria) using genotyping-by-sequencing. Genome. 2020 Nov;63(11):535-545. doi: 10.1139/gen-2020-0050.
  • Charr JC, Garavito A, Guyeux C, Crouzillat D, Descombes P, Fournier C, Ly SN, Raharimalala EN, Rakotomalala JJ, Stoffelen P, Janssens S, Hamon P, Guyot R. Complex evolutionary history of coffees revealed by full plastid genomes and 28,800 nuclear SNP analyses, with particular emphasis on Coffea canephora (Robusta coffee). Mol Phylogenet Evol. 2020 Oct;151:106906. doi: 10.1016/j.ympev.2020.106906.
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  • Sanchez-Ocampo, M., Segura-Giraldo, B., Florez-Hurtado, R., & Cortés-Aguirre, C. (2016, April). Design of a prototype device for remote patient care with mild cognitive impairment. In Journal of Physics: Conference Series (Vol. 705, No. 1, p. 012045). IOP Publishing.
  • Construcción y validación de un equipo de ventilación mecánica para terapia intensiva basado en mecanismos modulares que garantice el abastecimiento mediante una línea de producción a bajo costo y de alto nivel de confiabilidad para el tratamiento de COVID-19
  • Sistema de ventilación no invasivo de presión positiva CPAP AIRFLIFE. 
  • Desarrollo de un sistema de visión artificial basado en redes neuronales y aprendizaje profundo para uso en procesos productivos y de logística.
  • Hacia el entendimiento de genomas de plantas de interés productivo usando técnicas de bioinformática, HPC e inteligencia artificial.
  • Implementación del Programa para diagnóstico y control de enfermedades crónicas no transmisibles y Cáncer de Cervix y mama, con el apoyo de TIC en el Departamento de Caldas
  • Detección de COVID-19 en imágenes de rayos X usando redes neuronales convolucionales
  • Identificación de marcadores moleculares sanguíneos, genéticos y electroencefalográficos de estrés en víctimas del conflicto armado colombiano.
  • Diagnóstico de la enfermedad de Parkinson mediante PREs, polisomnografía y microbiota intestinal
  •  Aplicación de redes neuronales convolucionales a Estegoanálisis
  • Detección temprana de la enfermedad de Parkinson mediante síntomas no motores
  • EKG 20 bits de resolución y bajo ruido.
  • Sensor y Holter de bioimpedancia.
  •  Electromiógrafo 18 bits de resolución.
  • Modulador microcontrolado para telemetría de datos sísmicos provenientes de geófonos.
  • Captura 3D de Marcha basada en Visión Estéreo
  • Acelerómetro de balance de fuerza
  • Control microcontrolado de ignición electrónica.
  • Programación segura estocástica de la generación en sistemas interconectados.
  • Desarrollo de algoritmos computacionales basados en el procesamiento digital de señales e imágenes para el soporte del diagnóstico médico.

 

Hurtado-Rincón, J. V., Restrepo, F., Padilla, J. I., Torres, H. F., & Castellanos-Dominguez, G. (2018, December). Functional connectivity analysis using the oddball auditory paradigm for attention tasks. In International Conference on Brain Informatics (pp. 99-108). Springer, Cham.

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Cardona. S, Cortes. D, Echeverri. I, Martinez. L,Márquez. C, Murillo. S, Trujillo. S (2020) Plataforma de rehabilitación para miembro superior en personas con hemiparesia. X Encuentro Regional de Semilleros de Investigación – RREDSI -

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Proyecto "Teleasistencia para el tratamiento de oxígeno domiciliario de neonatos"

Chatbot orientado a resolver las dudas más frecuentes que puedan llegar a tener los acudientes de los pacientes neonatos en teleasistencia con oxígeno domiciliario, el Chatbot ofrece distintas categorías en las que se ofrece información sobre cuidados de los neonatos, signos vitales, teleasistencia y otros temas que pueden llegar a ser de interés para los acudientes. El Chatbot está desplegado en WhatsApp la cual es una plataforma de mensajería ampliamente usada, lo cual facilita el uso y acceso para los acudientes.

Autores: Profesores: Carolina Márquez Narváez, Santiago Murillo Rendón, Isabel Cristina Echeverri Ocampo. Jóvenes investigadores: Carlos Alberto Vera Betancourt, Daniel Henao Díaz.

Aplicación:
Aplicación interactiva que permita agrupar las carillas educativas para los acudientes de los neonatos oxígeno requirentes en casa. De igual manera, brindarles a los acudientes una serie de videos en los cuales se explican algunas técnicas que deben de tener en cuenta y dan algunas recomendaciones para el cuidado de neonato oxígeno requirentes.  


Reanimación cardiopulmonar:
Se presentan las técnicas, recomendaciones y paso a paso de la reanimación cardiopulmonar neonatal. Dentro del video se explica de manera detallada y especifica los pasos que deben de seguir los acudientes de los neonatos para realización dicha reanimación. 


Manejo de oxígeno:
Se presentan recomendación y pasos a seguir de los elementos que se entregan para la administración de oxígeno de los neonatos en casa. Se realiza una pequeña descripción de cada uno de los componentes entregados por las EPS, se muestra cómo es el elemento y se explica cómo es el ensamble de cada uno de los elementos para el suministro de oxígeno. De igual manera, se muestran algunas de las recomendaciones que deben de considerar al momento de la instalación de los elementos y el cuidado de estos.  


Teleasistencias para el neonato con oxigenoterapia: 
Se explica mediante un vídeo animado cómo es el funcionamiento del sistema de teleasistencia y que se hace con la información obtenida por cada uno de los sensores a utilizados para el monitoreo de oxígeno de los neonatos. 
Cuidados básicos
Se dan algunas recomendaciones y advertencias que deben de seguir los acudientes del neonato oxígeno requirente en casa.

El video “Manipulación y Uso del Sistema de Telemonitoreo”, pretende familiarizar a los acudientes con los dispositivos que hacen parte de este sistema, su importancia y funcionamiento. En este caso, se puede observar la conexión y el uso del sensor de presión que se usará para el cálculo del oxígeno que se le suministra al bebé y que generará una alarma cuando exista un cambio.

Profesores: Isabel Cristina Echeverri Ocampo, Santiago Murillo Rendón, Carolina Márquez Narváez, 
Jóvenes investigadores: Valentina Durango Gómez

Teleasistencia para el tratamiento de oxígeno domiciliario de neonatos

Profesores: Santiago Murillo Rendón, Carolina Márquez Narváez, Isabel Cristina Echeverri Ocampo
Jóvenes investigadores: Natalia Ramírez Restrepo, Estefanía Rodríguez Ospina 

Videotutorial: Instrucciones de manejo del software CXR Covid Detector

Videotutorial: Instalación del software CXR Covid Detector

Videotutorial: Preparación de las imágenes para entrenamiento de modelos

Mis primeras respiraciones 

Docentes: Santiago Murillo Rendón, Carolina Márquez Narváez, Isabel Cristina Echeverri Ocampo Jóvenes investigadores: Estefanía Rodríguez Ospina Daniel Henao Díaz.

Actividades de apropiación social del conocimiento en tecnología para reentrenamiento de la marcha

Modelos de inteligencia artificial en el software CXR Covid Detector

¿Qué es CXR y Cómo acceder al software?

Manipulación y uso del sistema de telemonitoreo

Profesores: Isabel Cristina Echeverri Ocampo, Santiago Murillo Rendón, Carolina Márquez Narváez, 
Jóvenes investigadores: Valentina Durango Gómez

  • Software computacional para el Diseño Cinemático Asistido por Computador de Robots Paralelos Simétricos 2-PRR (2020)
  • Software Smart Pet Bin (2020)
  • TIP_finder (2020)
  • SIPRES Analyzer (2019)
  • Impactor (2018)
  • ERP Shape (2018)
  • Aplicación mediante Android para control de Robot Móvil terrestre a través de WiFI. (2017)
  • Preview (forma ágil para visualizar amplitudes y latencias en el estudio de los potenciales relacionados a eventos-ERP) (2017)
  • Sistema de Visualización y Análisis de archivos Mocap  C3D® para fútbil mediante MATLAB® (2017)
  • Herramienta de diagnóstico asistido por computador de deterioro cognitivo leve basado en test cognitivos, árboles de decisión y redes artificiales (2017).
  • Prótesis para amputación transtibial elaborada en material compuesto reforzado con fibra de guadua. (2019)
  • Kit para juego de Boccia. (2018)
  •  Caja de Aprendizaje Instrumental Para Experimentos con Animales (2010)
Jóvenes Investigadores

Diana Marcela Castaño Álvarez
Título del Proyecto:   

Diseño de implementación de un sistema integrado de plantillas instrumentadas y sensores inerciales para la medición de presiones plantares y variables cinemáticas del pie


Programa Académico:   
Ingeniería Biomédica
Ingeniería Electrónica

Grupo de Investigación:   
Automática
Cuerpo y Movimiento

Modalidad:   
Tradicional

Juan Camilo Velásquez Rivera
Título del Proyecto:   

Teleasistencia: deterioro cognitivo


Programa Académico:   
Ingeniería de Sistemas
Ingeniería Biomédica

Grupo de Investigación:   
Neuroaprendizaje
Automática
Ingeniería de Software

Joven investigador:   
Pregrado
Natalia Betancur Herrera

Natalia Betancur Herrera
Título del Proyecto:   

Ingeniera Biomédica / Ingeniera Electrónica


Grupo de Investigación:   
AIRFLIFE
Automática

Juan Camilo Flórez Ruiz
Título del Proyecto:   

Teleasistencia: deterioro cognitivo


Programa Académico:   
Ingeniería de Sistemas

Grupo de Investigación:   
Neuroaprendizaje
Automática
Ingeniería de Software

Joven investigador:   
Profesional